Η χρήση του Linux αλλά και γενικότερα των συστημάτων UNIX, μέχρι τώρα αφορούσε κατά κύριο λόγο υπηρεσίες διακομιστών (servers) και η απόδοση και καλή λειτουργία αυτών των συστημάτων ήταν μεγίστης σημασίας. Η διατήρηση ενός διακομιστή σε καλή κατάσταση και συνεχή λειτουργία αποτελεί ευθύνη ειδικών χρηστών, των διαχειριστών συστημάτων (system administrators), οι οποίοι για το σκοπό αυτό χρησιμοποιούν διάφορα εργαλεία ή και χαρακτηριστικά που προσφέρει το ίδιο το σύστημα. Η διαχείριση συστήματος περιλαμβάνει από απλή επίβλεψη (monitoring) των πόρων του συστήματος, πληροφόρηση των τεχνικών χαρακτηριστικών του συστήματος και βελτιστοποίηση των παραμέτρων του πυρήνα (kernel fine-tuning), διαχείριση των συσκευών που είναι συνδεδεμένες στο σύστημα, των διεργασιών, των χρηστών και των ομάδων και τέλος των υπηρεσιών (services) που τρέχουν στο σύστημα.