Στην γραμμή εντολών το κέλυφος αναμένει τις εντολές σας. Αυτές μπορεί να είναι ενδογενείς εντολές του ίδιου του κελύφους bash, εντολές του συστήματος ή ακόμη και εκτελέσιμα προγράμματα. Ο τρόπος εκτέλεσης είναι ο ίδιος σε κάθε περίπτωση.
Ως ενδογενείς εντολές του κελύφους εννοούμε εντολές που δεν έχουν φυσική υπόσταση ως αρχεία στο σκληρό δίσκο. Είναι απλώς εντολές ελέγχου και ρύθμισης του ίδιου του κελύφους. Μερικά παραδείγματα τέτοιων εντολών με τις οποίες θα ασχοληθούμε στον οδηγό αυτό είναι:

alias

Δημιουργεί ψευδώνυμα εντολών

cd/pwd

Ορίζει/Επιστρέφει τον τρέχοντα κατάλογο.

echo

Τυπώνει το κείμενο που δίνεται ως παράμετρος.

eval

Υπολογίζει την τιμή μιας αριθμητικής ή λογικής παράστασης.

export

Καθιστά γνωστή στο περιβάλλον μεταβλητών του κελύφους την δοθείσα μεταβλητή και την τιμή της.

exit

Έξοδος από το κέλυφος.

history

Επιστρέφει το ιστορικό των τελευταίων εντολών του κελύφους.

Jobs

Επιστρέφει τις εργασίες που τρέχουν στο παρασκήνιο.

kill

Τερματίζει ή στέλνει σήμα (signal) στην δοθείσα διεργασία.

ulimit

Ορίζει τα όρια κατανάλωσης πόρων από μια διεργασία.

Το κέλυφος bash προσφέρει περισσότερες ενδογενείς εντολές αλλά η καταγραφή και επεξήγησή τους ξεφεύγει από τα όρια του οδηγού αυτού.